Suspectul (ne) obișnuit al romanului Coronavirus de origine liliecie

A studiu recent identifică il nou coronavirus responsabil pentru epidemia de pneumonie din provincia Hubei din China—Virusul de origine liliac este legat de alte coronavirusuri patogene cunoscute

2019 noul coronavirus (CoV) provoacă pneumonie fatală care a provocat peste 1300 de vieți, cu peste 52000 de cazuri confirmate de infecție de către 13 februarie 2020, totul în interval de puțin peste o lună. Dar, ce este acest virus? Este cu totul un nou virus? De unde a venit? Oamenii de știință din institutele de cercetare de top din China s-au unit pentru a răspunde la aceste întrebări, iar acest studiu de pionierat a fost publicat în Jurnalul medical chinezesc.

https://www.youtube.com/watch?v=jFKWluuMdgs

La începutul lunii decembrie, câțiva oameni din orașul Wuhan din provincia Hubei din China au început să se îmbolnăvească după ce au mers pe o piață locală de fructe de mare. Au prezentat simptome precum tuse, febră și dificultăți de respirație și chiar complicații legate de sindromul de detresă respiratorie acută (ARDS). Diagnosticul imediat a fost pneumonia, dar cauza exactă a fost inexplicabilă. Ce a cauzat acest nou focar? Este sindromul respirator acut sever (SARS) -CoV? Este sindromul respirator din Orientul Mijlociu (MERS) -CoV? După cum se dovedește, oamenii de știință au întreprins un studiu pentru a identifica acest virus în decembrie, după ce au analizat primele cazuri. Acest studiu este acum publicat în Jurnalul medical chinezesc iar identitatea virusului a fost stabilită - este un virus complet nou, strâns legat de CoV de tip SARS de liliac. Dr. Jianwei Wang (Academia Chineză de Științe Medicale, Institutul de Biologie Patogenă), cercetător principal al studiului, afirmă:Lucrarea noastră a stabilit identitatea CoV de origine a liliecilor, care până acum nu era cunoscută.Matei 22:21

În acest studiu, oamenii de știință din renumite institute de cercetare din China, precum Academia Chineză de Științe Medicale, Institutul de Biologie Patogenă, Spitalul de Prietenie China-Japonia și Colegiul Medical al Uniunii Peking, au descoperit și identificat împreună noul CoV - principalul vinovat al focarul de la Wuhan - prin secvențierea următoarei generații (NGS). Aceștia s-au concentrat asupra a cinci pacienți internați la spitalul Jin Yin-tan din Wuhan, dintre care majoritatea erau muncitori pe piața fructelor de mare Huanan din Wuhan. Acești pacienți au avut febră mare, tuse și alte simptome și au fost diagnosticați inițial cu pneumonie, dar cu o cauză necunoscută. Starea unor pacienți s-a înrăutățit rapid la ARDS; unul chiar a murit. Dr. Wang spune: „Radiografia toracică a pacienților a prezentat unele opacități și consolidări tulburi, care sunt tipice pneumoniei. Cu toate acestea, am vrut să aflăm ce a cauzat pneumonia, iar experimentele noastre ulterioare au dezvăluit cauza exactă—Un nou CoV care nu era cunoscut înainte.Matei 22:21

Pentru studiu, oamenii de știință au folosit probe de lichid bronhoalveolar (BAL) prelevate de la pacienți (BAL este o procedură în care lichidul steril este transferat în plămâni printr-un bronhoscop și apoi colectat pentru analiză).

În primul rând, oamenii de știință au încercat să identifice virusul prin secvențierea genomului, folosind tehnologia NGS. NGS este metoda de screening preferată pentru identificarea agenților patogeni necunoscuți, deoarece detectează și exclude rapid toate microorganismele patogene cunoscute din probă. Pe baza secvențierii ADN / ARN din probele de fluid BAL, oamenii de știință au descoperit că majoritatea citirilor virale aparțineau familiei CoV. Oamenii de știință au asamblat apoi diferitele „citiri” care aparțineau CoVs și au construit o întreagă secvență genomică pentru noul virus; aceste secvențe au fost de 99.8-99.9% similare între toate probele pacienților, confirmând că acest virus a fost agentul patogen comun la toți pacienții. Mai mult, folosind analiza omologică, în care o secvență de genom este comparată cu alte secvențe de genom cunoscute (cu un prag prestabilit de 90% pentru a fi considerată o „nouă” secvență), au confirmat că secvența de genom a acestui nou virus este de 79.0% similar cu SARS-CoV, aproximativ 51.8% similar cu MERS-CoV și aproximativ 87.6-87.7% similar cu alte CoV de tip SARS de la liliecii de potcoavă chinezi (numiți ZC45 și ZXC21). Analiza filogenetică a arătat că secvențele celor cinci tulpini CoV obținute au fost cele mai apropiate de cele ale tulpinilor derivate din lilieci, dar au format ramuri evolutive separate. Aceste descoperiri sugerează în mod clar că virusul provine de la lilieci. Dr. Wang afirmă: „Deoarece asemănările genei replicazei virale cu toți ceilalți viruși „similari” cunoscuți sunt încă mai mici de 90% și, luând în considerare și rezultatele analizei filogenetice, considerăm că acesta este într-adevăr un CoV nou, necunoscut anterior. Acest nou virus este numit temporar 2019-ncov.Matei 22:21

În cele din urmă, oamenii de știință au trecut la „izolarea” virusului de probele de lichid BAL verificând dacă probele de lichide au prezentat efect citopatic la liniile celulare din laborator. Celulele expuse probelor de lichid au fost observate la microscopul electronic, iar oamenii de știință au găsit structuri caracteristice asemănătoare CoV. De asemenea, au folosit imunofluorescența - o tehnică care folosește anticorpi specifici marcați cu coloranți fluorescenți. Pentru aceasta, au folosit ser de la pacienții în recuperare (care conțineau anticorpi), care au reacționat cu particulele virale din interiorul celulelor; acest lucru a confirmat că acest virus a fost într-adevăr cauza infecției.

Acest studiu deschide calea către viitoarele studii pentru a înțelege mai bine virusul și sursele acestuia, mai ales având în vedere răspândirea rapidă, capacitatea sa de a provoca ARDS fatală și panica cauzată de focar. Deși 4 din cei 5 pacienți de la care a fost identificat acest virus provin de pe o piață de fructe de mare din Wuhan, originea exactă a infecției este necunoscută. CoV ar fi putut fi transmis oamenilor printr-un purtător „intermediar”, cum ar fi în cazul SARS-CoV (carne de civet de palmier) sau MERS-CoV (cămilă). Dr. Wang concluzionează: „Toate CoV-urile umane sunt zoonotice și mai multe CoV-uri umane au provenit de la lilieci, inclusiv SARS- și MERS-CoV. Studiul nostru arată în mod clar nevoia urgentă de monitorizare regulată a transmiterii la om a CoV-urilor de lilieci. Apariția acestui virus este o amenințare masivă pentru sănătatea publică și, prin urmare, este de o importanță crucială să înțelegem sursa acestui virus și să decidem următorii pași înainte de a asista la un focar la scară mai mare.. "