CDC a lansat un consorțiu privind genomica virală națională

Centrele SUA pentru Controlul și Prevenirea Bolilor, CDC, au lansat un consorțiu pentru a lansa o rețea națională de laboratoare de secvențiere care va accelera eliberarea datelor secvenței SARS-CoV-2 în domeniul public. Eliberarea rapidă a datelor secvenței coronavirusului deschis va ajuta la ghidare Covid-19 răspunsul la sănătatea publică, stimulează inovația și descoperirea și înțelegeți în avans această și pandemia viitoare.

Acest Secvențierea SARS-CoV-2 pentru intervenții de urgență, epidemiologie și supraveghere în domeniul sănătății publice (SPHERES) consorțiu, care va extinde mult utilizarea secvențierea genomului întreg (WGS) a virusului COVID-19. SPHERES va furniza date consecvente, în timp real, secvenței echipelor de răspuns la sănătatea publică care investighează cazuri și grupuri de COVID-19 din toată țara.

Acest nou consorțiu îi va ajuta să înțeleagă mai bine modul în care virusul se răspândește, atât la nivel național, cât și în comunitățile lor locale. La rândul lor, date mai bune vor ajuta oficialii din domeniul sănătății publice să întrerupă lanțurile de transmisie, să prevină noi cazuri de boli și să protejeze și să salveze vieți.

„SUA este liderul mondial în secvențierea rapidă a genomului. Acest efort coordonat în laboratoarele noastre publice, private, clinice și academice de sănătate publică va juca un rol vital în înțelegerea transmiterii, evoluției și tratamentului SARS-CoV-2. Sunt încrezător că mințile noastre cele mai bune și mai calificate lucrează împreună pentru a ne ajuta să salvăm vieți astăzi și mâine ”, a declarat directorul CDC, Robert Redfield, MD

Urmărirea virusului COVID-19 pe măsură ce evoluează

Datele secvenței genomice pot oferi o perspectivă fără precedent asupra biologiei SARS-CoV-2, virusul care cauzează COVID-19 și poate ajuta la definirea peisajului în schimbare al pandemiei. Prin secvențierea virușilor din Statele Unite, CDC și alte autorități de sănătate publică pot monitoriza modificările importante ale virusului și pot utiliza aceste informații pentru a ghida urmărirea contactelor, eforturile de atenuare a sănătății publice și strategiile de control al infecțiilor.

Consorțiul SPHERES este un efort ambițios de coordonare a secvențierii genomului SARS-CoV-2 la nivel național, organizând zeci de eforturi individuale mai mici într-o singură rețea distribuită de laboratoare, instituții și corporații. Consorțiul combină expertiza, tehnologia și resursele a 40 de departamente de sănătate publică de stat și locale, mai multe laboratoare clinice mari și peste două duzini de instituții colaboratoare din guvernul federal, mediul academic și sectorul privat.

SPHERES va stabili cele mai bune practici și standarde de consens de date, va accelera schimbul deschis de date și va stabili un fond de resurse și expertiză pentru a contribui la aducerea tehnologiei de vârf la răspunsul COVID-19 național.

Datele SPHERES sunt deschise, partajate

Membrii consorțiului își împărtășesc angajamentul pentru partajarea rapidă a secvențelor deschise. Ei intenționează să trimită toate datele secvenței utile în depozitele publice de la Centrul Național de Informații despre Biotehnologie al Bibliotecii Naționale de Medicină (NLM / NCBI), Inițiativa globală privind partajarea datelor de gripă aviară (GISAID) și alte depozite de secvențe publice. Acest lucru va contribui la asigurarea faptului că datele secvenței virale din Statele Unite sunt disponibile rapid pentru luarea deciziilor în domeniul sănătății publice și accesibile în mod liber cercetătorilor de pretutindeni.

Membrii consorțiului includ:

Agenții și laboratoare federale

Centre for Control and Prevention Disease, Office of Advanced Molecular Detections

Argonne National Laboratory

Agenția de Sănătate a Apărării, Infecțios global Boală Monitorizarea

Food and Drug Administration

Laboratorul Național Lawrence Berkeley

Laboratorul Național Los Alamos

Institutul Național de Alergii și Boli Infecțioase, Biroul de Genomică și Tehnologie Avansată

Institutul Național de Standarde și Tehnologie

Centrul Național de Informații despre Biotehnologie al Bibliotecii Naționale de Medicină

Institutul de Cercetare al Armatei Walter Reed

Laboratoare de sănătate publică de stat / locale

Arizona

California

Delaware

District of Columbia

Florida

Hawaii

Maine

Maryland

Massachusetts

Michigan

Minnesota

Carolina de Nord

Dakota de Nord

Nevada

New Mexico

New York

Utah

Virginia

Washington

Wisconsin

Wyoming

Instituții academice

Universitatea Baylor

Universitatea Cornell

Fred Hutchinson Centrul de cercetare a cancerului

Școala de Medicină Muntele Sinai

Universitatea din New York

Universitatea din Arizona de Nord

Universitatea din Buffalo

University of California, Berkeley

Universitatea din California, Davis

Universitatea din California, Irvine

Universitatea din California, Los Angeles

Universitatea din California, San Francisco

Universitatea din California, Santa Cruz

Universitatea din Chicago

Universitatea din Maryland

Universitatea din Minnesota

Universitatea din Nebraska

Universitatea din New Mexico

Universitatea din Washington

universitatea Yale

Corporații

Diagnosticul Abbott

bioMerieux

Genomica culorii

Gingko Bioworks

IDbyDNA

In-Q-Tel

LabCorp

Un Codex

Tehnologii Oxford Nanopore

Pacific Biosciences

Qiagen

Diagnostic de misiune

Cu adevărat Științele Vieții

Numele corporațiilor sunt furnizate doar în scop informativ, iar includerea lor aici nu constituie o aprobare a corporațiilor sau a oricăruia dintre produsele sau serviciile lor comerciale de către Centrele SUA pentru Controlul și Prevenirea Bolilor.

Institute de sănătate publică sau de cercetare non-profit

Asociația Laboratoarelor de Sănătate Publică

Bill și Melinda Gates Foundation

Institutul larg

Chan Zuckerberg BioHub

Institutul Craig Venter

Alianța pentru sănătate publică pentru epidemiologie genomică

Cercetarea Scripps

Laboratorul Jackson

Institutul de Cercetare a Genomicii Translaționale - Nord

Fundația Walder

În ultimii șase ani, programul CDC al Biroului de Detecție Moleculară Avansată a investit în laboratoare federale și de stat de sănătate publică pentru a extinde utilizarea genomicii patogenilor și a altor tehnologii avansate de laborator pentru supravegherea bolilor infecțioase și răspunsul la focar. Investiția actuală a consorțiului își propune să salveze vieți în pandemia SARS-CoV-2 și să pregătească Statele Unite și lumea pentru răspunsul pandemic viitor.

Pentru a afla mai multe despre secvențierea genomică sau activitatea CDC în detectarea moleculară avansată, vizitați https://www.cdc.gov/amd/